Ozon behandling kanskje. Men ville vært bekymret for hva som er på baksiden når det ser slik ut. Mitt forslag kan derfor kanskje også brukes på det som er igjen etter at det er åpnet, vil jo tro at bjelker bak heller ikke trenger å våre så pene som en hadde håpet.

Ozon, hva er det? :-p
Jeg deler nok din tanke om hvordan bjelkene ser ut desverre. Blir nok å bruke helgen på riving istede for å bygge opp.

Det er oksygen satt sammen av tre oksygen atomer, ikke 2 slik som vanlig. Det desinfiserer, sanerer og spiser lukt. Jeg har brukt det i hus for å fjerne røyklukt etter brann der forsikring ikke var iorden. Hjalp til etterpå og alle rom hvor en ikke hadde noe som ikke kunne vaskes bort ble bra. Men Ozon er helseskadelig, jeg satte den på via koblingsur slik at den slo seg av selv etterpå.  Det er det at det spalter seg raskt til vanlig oksygen som er årsaken at det virker, da blir det et ledig oksygen atom som gjerne reagerer med noe og dermed "spiser" dette.  
Vet ikke hvor TS bor men jeg har enheten enda, har ikke solgt den som planlagt, jeg bor utenfor Trondheim.  En "skoeske" med en spesiell lampe inne i og en liten vifte.

kanskje bare noe sånn? https://www.jotun.com/no/no/b2c/products/exterior/jotun/jotun-sopp-og-algedreper.aspx
Eventuelt bare vaske det godt med for eksempel kloring?
Trodde ikke det utviklet seg noe mer så lenge det forble tørt?

Sopp og algedreper er for grønske og svertesopp på utendørs maling men står jo at den i mer konsentrert form desinfiserer. Men jeg er som sagt mest redd for hva som er bak en så omfattende ytre skade. Vi har kjellertråden her som forteller om "Aud" som han hadde på besøk og hvor ting tilsynelatende ikke så så galt ut på de første bildene.

Ja sant. men står den kan brukes på ubehandlede flater ute og inne. Han som hadde Aud på besøk, hadde vell stort sett konstant vann rennende under gulvet? blir jo ett ganske annet klima da.

Jo men sagflis som har vært våt kanskje i lag tid, vet ikke hvordan den er nå men forstår problemet.  Tok ned stubbloft i kjeller fra 1931 og vi tok ikke bort noe mere enn nødvendig for å si det slik.  Der var det også for å reparere en gammel skade som var tørr på den tiden.  Bjelkene her var i praksis bare et skall som lå inn på grunnmuren. Problemet var at det var kun 1 cm ut fra veggen en hadde problemet med bjelkene slik at jeg bodde der i mange år før problemet ble oppdaget.  Gulvbord over var så kraftige at det ikke gjorde noe om to bjelker bare hang i luften. 

Sagflisen kan se ti ganger verre ut, anbefaler verneutstyr, og det er ikke sikkert lekkasjen har stoppet helt heller.
Jeg mener det er veldig viktig å få sjekket tilstanden der inne.
Bord er ikke så veldig dyre egentlig, og Rockwool slipper ut fukten, det gjør ikke sagflis, som garantert har vært/er våt der.

Hei igjen.
Takk for alle svar!
Kommer her med en liten oppdatering.
Jeg har revet opp i etasjen over, bak en knevegg like under selve taket. Til min store overraskelse så det rimelig bra ut. Bjelkene va helt fine, og sagflisen så ganske normal ut. Oversiden av bordene så nesten bedre ut enn undersiden.

Mannen på maleravdelingen på byggmakker mente det kunne være en løsning å vaske av overflatesoppen/muggen og la det tørke, for så å smøre inn bordene med kvistlakk for å "tette" bordene. Dette mente han at var blitt gjort av andre også.

Jeg kommer nok uansett til å skifte ut bordene, og sagflisen blir om noen måneder skiftet ut med isolasjon når jeg skal gå løs på etasjen over.

Ja er nok like greit å fjerne bordene da. du skal vel ha noe form for plater eller panel i taket uansett? så da har du kanskje ikke så veldig bruk for bord der?