"En sånn server stående".... er dette en egen NAS-boks eller noe?
Et navn/type hadde hjulpet stort å vite.  :)

Generelt så er det ofte et RAID-oppsett på slike NAS eller JBOD (just a bunch of discs).
Er det RAID så må du inn på selve enheten (den har sikkert en webside eller program for å sette denne opp)  og legge inn den nye disc'en slik at den blir med i raid'et.

Windows 2011 server
på en mini server - husker ikke merke.
men har 4 plasser til disker i sånn plasthylster.

Du sier Windows 2011 server, det er vel da Windows Home Server 2011 og da må du vel klargjøre disken inne i dashbordet?
http://technet.microsoft.com/en-us/library/gg590018.aspx

har jeg disken i, booter serveren ikke opp.. den kommer ikke på nettverket. (har ikke skjerm på den).
'kobler jeg fra disken, så booter den vanlig å fint opp..

??

Den stopper vel i BIOS med beskjed om at konfigurasjonen er endret, og at du må trykke F1 for å fortsette eller gå inn i BIOS for å sjekke innstillingene.
Mulig dette bare gjelder vanlig PC, men kan hende det gjelder servere også.

Må man endre jumper-setting for master/slave på en serverdisk?

Hva mener du med serverdisker? Normalt kjøper du vanlige satadisker uten jumpere og må huske å partisjonere og formatere disken før du tar disken i bruk. I Windows gjøres dette i diskbehandling. Finner du ikke disken der så kan det være lurt å gå i bios/uefi for å se til at disken ble oppdaget under oppstart.

Etter disken er partisjonert kommer den opp i min datamaskin og kan formateres om du ikke gjorde det under partisjonering. Deretter kan du bruke den.